As primeiras bat caves do Brasil, cavernas que abrigam grandes colônias de morcegos, foram descobertas no Cerrado dos estados de Tocantins e Goiás. A constatação foi feita a partir do Plano de Ação Nacional para Conservação do Patrimônio Espeleológico Brasileiro (PAN Cavernas do Brasil), do Centro Nacional de Pesquisa e Conservação de Cavernas (ICMBio/Cecav).
No Tocantins, as cavernas Boa Esperança e Casa de Pedra foram caracterizadas como bat caves. A primeira abriga uma colônia de cerca de 10 mil morcegos, com a presença das espécies Phyllostomus hastatus, Anoura geoffroyi e Pteronotus rubiginosus.
A caverna Casa de Pedra tem mais de 157 mil indivíduos e é a casa de uma das maiores colônias já registradas no Brasil. O local abriga as espécies Pteronotus rubiginosus, Anoura geoffroyi e poucos indivíduos de Natalus macrourus, espécie ameaçada de extinção no país.
Já em Goiás, a Gruta do Jacaré tem população de mais de 20 mil indivíduos, de pelo menos sete espécies, incluindo Pteronotus gymnonotus, Pteronotus personatus, Pteronotus rubiginosus, Lonchorhina aurita e Natalus macrourus.
O Brasil abriga 188 espécies de morcegos, quatro delas atualmente classificadas como ameaçadas de extinção: Natalus macrourus, Furipterus horrens, Lonchophylla dekeyseri e Lonchophylla bokermanni. As duas últimas também constam na Lista Vermelha global da União Internacional para a Conservação da Natureza (IUCN, na sigla em inglês).
