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Ele assumiu o cargo de comandante do Tricolor paulista em 20 de abril de 2024, no lugar de Thiago Carpini, que teve um desempenho ruim no início daquele ano. Rapidamente, o temperamento agitado do argentino surtiu efeito em campo, e a equipe melhorou seu rendimento.
Com uma atenção especial à Copa Libertadores, na qual parou nas quartas de final, o São Paulo fez uma campanha segura no Campeonato Brasileiro e garantiu uma vaga para a maior competição continental ao final da temporada.
No entanto, o trabalho já era criticado pela falta de resultados e constância. Em 2025, a situação se intensificou. Após uma sequência ruim no Campeonato Brasileiro, Zubeldía foi demitido no dia 16 de junho. O jogo decisivo foi uma derrota por 3 a 1 para o Vasco, no Morumbis.
Apesar desse cenário, uma parte da torcida são-paulina se opôs à demissão do argentino, ao argumentar que o time não conseguia desempenhar devido ao alto número de lesionados.
Números de Zubeldía no São Paulo
2024 - 45 jogos - 21 vitórias, 12 empates e 12 derrotas
2025 - 29 jogos - 14 vitórias - 10 empates - 5 derrotas
Ao todo: 74 jogos - 35 vitórias, 22 empates e 17 derrotas
- 57.2% aproveitamento
- 97 gols marcados (1.3 por jogo)
- 66 gols sofridos (0.9 por jogo)
